Vedoucí
Hlavní výzkumné činnosti
- návrh a vývoj algoritmů pro segmentaci a klasifikaci buněk v obrazových datech
- návrh a vývoj algoritmů pro hodnocení viability buněk v obrazových datech při různých typech experimentů
- návrh a vývoj metod pro zpracování obrazů z kvantitativní fázové mikroskopie
- analýza obrazů a dat získavaných při experimentech na buňkách či tkáňových strukturách
Hlavní výsledky výzkumu - praktické
- implementace metodiky pro hodnocení tuhosti buněk při aplikaci smykového napětí v průtokových komůrkách
- sada algoritmů pro segmentaci buněk v obrazech z různých zobrazovacích modalit
Hlavní výsledky výzkumu - publikace
- Probabilistic Noise2Void: Unsupervised Content-Aware Denoising
- The Quantitative-Phase Dynamics of Apoptosis and Lytic Cell Death
- Cisplatin enhances cell stiffness and decreases invasiveness rate in prostate cancer cells by actin accumulation
- Cell segmentation methods for label-free contrast microscopy: review and comprehensive comparison
- Self-supervised pretraining for transferable quantitative phase image cell segmentation
- DeepFoci: Deep Learning-Based Algorithm for Fast Automatic Analysis of DNA Double-Strand Break Ionizing Radiation-Induced Foci
